Da die MRT-Technologie keine Röntgenstrahlen verwendet, ist sie weniger invasiv als eine Computertomographie (CT). Die MRT basiert auf supraleitenden Elektromagneten, die ein Feld erzeugen. Die zufällig orientierten Kerne der Wasserstoffatome (H2O ist das wichtigste Molekül im menschlichen Körper ≃ 60 %) in jeder Zelle des ausgewählten Teils unseres Körpers werden dazu gebracht, sich in dem starken magnetischen Feld auszurichten. Wenn jedoch ein Gewebe geschädigt ist, bleiben die Atome in diesem Gewebe unangepasst und richten sich nicht wie erwartet gleichmäßig aus. Wenn der Magnet ausgeschaltet wird, kehren die Wasserstoffatome allmählich in ihre ursprüngliche Position zurück, und während sie dies tun, sendet jedes Wasserstoffteilchen, ob in einem normalen oder abnormalen Gewebe, eine bestimmte Art von Energie aus. Diese Energie wird dann von einer empfindlichen Antenne erfasst, die die Daten in Form von Signalen an das Computersystem weiterleitet. Das Computersystem wandelt das Signal schließlich in ein Bild um, das von einem Radiologen interpretiert wird. Während des Ablaufs einer MRT-Untersuchung werden vom Gerät verschiedene Sequenzen erzeugt, von denen einige nach einer Injektion von Gadolinium durchgeführt werden müssen, das anatomische Strukturen unter bestimmten technischen Bedingungen verstärkt. Im Gegensatz zur Computertomographie (CT), bei der nur transversale Aufnahmen des Körpers angefertigt werden, ist die MRT in der Lage, den menschlichen Körper in allen Achsen abzubilden, wobei vor allem transversale [axiale] (Kopf-Fuß-Achse), sagittale (Rechts-Links-Achse) und koronale (Vorder-Hinter-Achse) Ansichten erzeugt werden.